酮康唑是一种杀真菌剂，并用于洗发水治疗由真菌感染导致的头皮屑。包含这种成分的洗发水经常用于治疗严重真菌感染。酮康唑浓度2%的洗发水能帮助控制中度头皮屑。洗发水必须按摩进头皮，并保持至少5分子才能有效清除感染。在使用含酮康唑的洗发水之前应咨询医生，因为这种成分有导致肝损伤的可能。研究表明酮康唑在雄激素性脱发或男性型脱发的长期治疗中起重要作用。由于真菌的细胞膜对它们的生存至关重要，酮康唑通过干扰这些细胞膜来杀死真菌。它也可以用于其他情况，如牛皮癣，头皮屑，男性模式脱发和更多。

研究表明，它也可能有助于阻止DHT并促进头发生长。一项比较局部使用酮康唑溶液和各种浓度的米诺地尔的研究发现，将酮康唑与米诺地尔一起使用比单独使用米诺地尔对头发生长的刺激更大。